8月7日，菲律宾国家调查局局长洛加斯公布了一份调查报告，调查报告上主要提了三点，一是船上的8名菲海岸警卫队成员全部对台湾人民的死亡负有责任，他们将以杀人罪被起诉，如果这个罪名成立，他们可能被判处12年-20年的有期徒刑。
另外，这份报告推翻了此前所说的“台湾渔船试图撞击菲律宾海岸警卫队执法船”的说法，说当时的海岸警卫队员并没有受到致命威胁，所以他们开枪是不合理的。有消息说，菲律宾总统特使佩雷斯今天将赴台湾道歉。据了解，菲律宾今天（8日）去台湾的航班只有早上一班，所以佩雷斯现在应该已经在去台湾的路上了。
这和之前菲律宾媒体宣传的要对台强硬绝不道歉，形成了天壤之别的反差，而且包括路透，法新社在内的西方媒体也第一时间报道了菲律宾的这次态度急剧的转变。
早在5月11日晚，台湾地区领导人马英九召开高层会议，向菲律宾提出道歉、赔偿、惩凶等四项要求，敦促菲方72小时内回应，否则将采取冻结菲劳等措施。不过事件发生后，菲律宾政府最初拒不道歉，之后又拖延敷衍，直至5月15日凌晨才表示“遗憾及道歉”
菲律宾方面，其海岸警卫队的公务船在海洋经济重迭区向台湾渔船射击，可能是出于极其复杂的心理。这是因为，菲律宾在中菲两国的南沙争议问题上，处于劣势，而其寄以深切期待的美国也不明确支持，心里早就怨了一肚子气，就向海峡两岸的渔民下手，以作报复。
马英九方面，事件之初的态度颇为软弱，因而被台湾蓝绿舆论骂个臭头。但在民情激愤之下，马英九却就不得不摆出一幅强硬的姿态。再说，马英九也有着不能让大陆抢夺了主导权的考虑。
菲律宾明显地是在大陆摆出强硬姿态之后，才终于软化了态度，大陆方面，今次的表现深得台湾民心。还有个例子：1991年海湾战争时，台湾驻科威特“代表”未待伊拉克军队杀到，就混在韩国的撤侨队伍中逃走，扔下台湾的中华工程公司的工程技术人员及家属一百三十六人，及上千名工人不管；
这些工人他们只得找到中国驻科威特大使馆，由馆方向他们发给中华人民共和国旅行证，并乘坐馆方的撤离车队离开伊拉克。到了约旦，中国驻约旦大使馆又为他们做了担保，并协助他们与其台北总公司取得了联系，得以撤回台湾。此事在台湾引起轰动，影响巨大。
这次菲律宾肯答应对肇事者绳之以法的一个重要原因，当然是私下里听说的，因为大陆的新成立的海警船已经在台湾渔船遇袭海域驾着机关炮巡逻，菲律宾渔民几欲发疯，天天去阿基诺的代办那里闹，在经过一番交易之后，菲律宾在对台湾渔民赔偿时间上给大陆一个交代，这对北京的统战工作来说也是很重要的。